Kasım 1092'de Büyük Selçuklu Sultanı Melikşah'ın ölümüyle taht boşalmıştır. Bu dönemde Sultan Melikşah'ın eşi Terken Hatun, oğlu Mahmud'u sultan ilan etmek istemiştir. Ancak meşru varis olarak kabul edilen Berkyaruk, tahta geçmiştir.
Taht kavgaları, Selçuklu İmparatorluğu'nu istikrarsız bir duruma sürüklemiştir. Birçok bölgesel vali ve yönetici, kendi bağımsızlıklarını ilan etmişlerdir. Melikşah'ın kardeşi Tutuş, Şam'da Suriye Meliki olmuş, Halep Emiri Aksungur el-Hacib bağımsızlığını ilan etmiştir. Diyarbakır Emiri ve diğer valiler de bağımsızlıklarını ilan etmişlerdir.
Berkyaruk'un dayısı ve kuzeni olan Yakut bin İsmail bin Davud, Mahmud'un sultanlığını kabul ettiğini açıkça bildirmiştir. Ancak bu karmaşık dönemde Selçuklu İmparatorluğu'nun birliği büyük ölçüde kaybolmuştur.
Taht Kavgaları ve Terken Hatun'un Rolü Terken Hatun, oğlu Mahmud'u sultan yapmak için büyük bir çaba harcamıştır. Melikşah'ın ölümünden sonra Berkyaruk'un tahta geçmesine karşı çıkmıştır. Bağdat'taki Abbasiler Halifesi Muktadi'yi de bu konuda haberdar etmiş ve beş yaşındaki Mahmud'u sultan ilan etmiştir.
Ancak Berkyaruk'un taraftarları Rey şehrine kaçırarak onu sultan ilan etmişlerdir. Bu durum, Selçuklu İmparatorluğu'nda büyük bir karışıklığa neden olmuştur. Mahmud'un annesi Terken Hatun ve onun destekçileri, İsfahan'da Berkyaruk'u yakalamak için Emir Kür-Boğa'yı göndermiştir.
Ancak Vezir Mustavi, Berkyaruk tarafından yakalanarak idam edilmiştir. Bu durum Terken Hatun ve Mahmud'un planlarını suya düşürmüştür.
Sonunda Terken Hatun ve Berkyaruk arasında anlaşma yapılmasına karar verilmiştir. Buna göre Terken Hatun ve oğlu Mahmud, İsfahan ve Fars bölgesinde tâbî hükümdar olarak hüküm süreceklerdir. Berkyaruk ise batıda Büyük Selçuklu Sultanı olarak hüküm sürecektir.
Ancak Terken Hatun'un ölümünden sonra Mahmud çiçek hastalığına yakalanarak 1094 yılında hayatını kaybetmiştir. Böylece Berkyaruk, Selçuklu İmparatorluğu'nu yeniden birleştirme görevini üstlenmiştir. Taht kavgaları ve iç karışıklıkların ardından imparatorluğun yeniden birleştirilmesi için çalışmalar başlamıştır.
